نسبه علماء العامّة ـ أهل السنّة ـ إلى الزيديّة بل جعلوه من أئمّة الزيديّة وادعو انّه كان يدعى الإمامة لنفسه لكن لم يثبت ذلك بل الظاهر انّه كان يعتقد بالأئمّة الإثني عشر وله كتاب « أنساب الأئمّة عليهم السلام ومواليدهم إلى صاحب الأمر » ، وله كتابات في الإمامة وله ولد يسمّى بأبي الحسن علي الذي كان يصرّح بأنّه على مذهب الإماميّة ويذمّ الزيديّة وله نقض على عبد الله بن المعتز في قصائده في ذمّ العلويين.وقد عدّ علماء الرجال من أصحاب الإمام الهادي عليه السلام كما قاله الشيخ الطوسي في رجاله وقد روى أحمد بن الحسن الحسيني عدّة روايات عن الحسن بن علي الناصر عن أبيه عن الإمام الجواد عليه السلام.قال السيّد المرتضى علم الهدى رضي الله عنه في حقّه وهو جدّه من قبل اُمّه : « وامّا أبو محمّد الناصر الكبير ففضّله في علمه وزهده وفقهه أظهر من الشمس الباهرة وهو الذي نشر الإسلام في الديم حتى اهتدوا به بعد الضلالة وعدلوا بدعائه عن الجهالة وسيرته الجميلة أكثر من أن تحصى ».ولأبي محمّد الحسن بن علي الناصر مسائل شرحها حفيده السيّد المرتضى وسمّاها الناصريّات. وقد ذكر النجاشي والمامقاني والأردبيلي وغيرهم الحسن بن علي بن الحسن بن عمر الأشرف ابن الإمام السجّاد عليه السلام أبو محمّد الأطروش رحمه الله وقالوا كان يعتقد الإمامة وله كتب ذكرها النجاشي وغيره. والظاهر اتّحاده مع الناصر الكبير وقد نسب جدّه إلى جدّه.وعلى كلّ حال فمع تصريحات علماء الرجال من الشيعة وعدّه من أصحاب الإمام الهادي عليه السلام وروايته عن أبيه عن الإمام الجواد عليه السلام لا يبقى شك في كونه إماميّاً إثنا عشريّاً.