يرجع تاريخ القبّة الحاليّة على قبر السيّدة المعصومة إلى سنة ( 529هـ ) ، حيث بُنيت بأمر من المرحومة ( شاه بيكم بنت عماد بيك ). أمّا تذهيب القبّة وبعض الجواهر التي رصّع بها القبر الشريف ، فهي من آثار فتح علي شاه القاجاريّ. وهناك فوق قبر السيّدة فاطمة صخرة عليها نقش كهيئة المحراب ، تحيط به آية الكرسيّ ، وكُتب في وسطه « توفيّت فاطمة بنت موسى في سنة إحدى ومائتين ».

مصلّى السيّدة المعصومة
ما يزال المحراب الذي كانت السيّدة فاطمة تصلّي فيه في دار موسى بن خزرج ماثلاً إلى الآن ، يقصده الناس لزيارته والصلاة فيه. وقد جُدّدت عمارته خلال السنوات الأخيرة ، وشُيّدت إلى جانبه مدرسة لطلبة العلوم الدينيّة تعرف بـ « المدرسة الستّيّة ». يقع المحراب في الشارع المجاور للصحن الشريف ، ويُعرف بشارع « چَهار مَرْدان » على يسار الذاهب من الروضة الفاطميّة ، وهو مزدان بالقاشاني المعرّف ، وعلى مدخله أبيات بالفارسيّة ، تعريبه : لقد شُيِّد هذا البناء المُنير إجلالاً لبنت موسى بن جعفر ، حيث مَثُل فيه محراب فاطمة المعصومة ، فزادت به « قم » شرفاً على شرف.