لمؤسّسة آل البيت (عليهم السلام) علاقات واسعة مع المؤسّسات والمراكز الجامعية المختلفة في ايران ، خصوصاً في القسم العلمي والثقافي ، وتتبادل معها المعلومات وتتعاون تعاوناً وثيقاً ، من خلال هذه العلاقات يمكن الوقوف أمام تكرار الأعمال التحقيقية المشابهة لكتاب واحد ، كما أنّ الاستشارة والتعاون العلمي تقدّمها المؤسّسة مساعدة لهم ، وما مكتبة مؤسّسة آل البيت (عليهم السلام) خير دليل على ذلك ، حيث هي مفتوحة أمام كلّ المجاميع العلميّة ، والمؤسّسات ، المراكز الثقافية ، وحتّى المحقّقين الذين يعملون أعمالاً فرديّة .
هذه المكتبة تحتوي إلى الآن على خمسة وعشرين ألف كتاباً في فروع العلم المختلفة مثل :
الحديث ، الفقه ، الأُصول ، اللُّغة ، الأدب ، التفسير ، العلوم القرآنيّة ، الكلام ، الفلسفة ، الرجال والتراجم ، إضافة إلى أنّها تحتوي على مخطوطات مختلفة وأفلام ومايكروفيلم ، وصور مستنسخة خطيّة كثيرة للمذاهب الإسلاميّة المختلفة .
إنّ هذه المؤسّسة إضافة إلى علاقاتها الواسعة مع المراكز الجامعية والعلميّة والمؤسّسات في داخل ايران ، لها علاقات واسعة أيضاً مع الكثير من الجامعات والمراكز والمؤسّسات في خارج ايران .
وعلى سبيل المثال لا الحصر فإنّ من جملة المراكز التي تمتلك المؤسّسة معها هذه المراسلات العلمية التي أشرنا إليها :
1- مجمع اللغة العربية في دمشق.
2- مكتبة الأسد في دمشق.
3- كلية الشريعة في قطر.
4- مكتبة الفرقان في البحرين.
5- مؤسسة آل البيت في الأردن.
6- جامعة السوربون في فرنسا.
7- المركز الإسلامي في ألمانيا.
8- جامعة بوخم في ألمانيا.
9- المركز الثقافي الإسلامي في سيراليون.
10- المركز الإسلامي في بلجيكيا.
11- جامعة قرطبة في إسبانيا.
12- مكتبة الإسكوريال في إسبانيا.
13- جامعة أهل البيت (عليهم السلام) في إيرلندا.
14- جمعية المسلمين الشيعة في أُستراليا.
15- المكتبة الملكية في الدنمارك.
16- جمعية المسلمين الشيعة في بورما.
17- المركز الثقافي الاسلامي في النيجريا.
18- البعثة الاسلامية في مدغشقر.
19- مكتبة مدرسة الدراسات الشرقية والأفريقية في بريطانيا.
20- المركز الاسلامي في بريطانيا.
21- المعرض البريطاني ( المكتبة البريطانية ).
22- جامعة دار الإسلام في تانزانيا.
23- المكتبة الوطنية في الأرجنتين.
24- مكتبة الغازي خسروبك في يوغسلافيا.
25- الاتحاد المسلم النشط في غانا.
26- مكتبة الأمم المتحدة في سويسرا.
27- مكتبة أكاديمية العلوم السوفيتية في روسيا.
28- مكتبة الكونغرس في أمريكا.
29- مركز التوجيه الإسلامي في أمريكا.
30- جامعة هارفارد في أمريكا.
31- جامعة برنستون في أمريكا.
32- جامعة يوتا في أمريكا.
33- جامعة تكساس في أمريكا.
34- مركز الأبحاث للتاريخ والفن والثقافة الاسلامية في تركيا.
35- مكتبة جامعة انقرة في تركيا.
36- معهد الدراسات العربية والاسلامية في إيطاليا.
37- دار الحكمة في باكستان.
38- المكتبة الناصرية في الهند.
39- جامعة مكّيل في كندا.
40- مكتبة جامعة أمستردام في هولندا.
الى غيرها من العشرات الأخر من المراكز العلمية والدور الأكاديمية في نقاط مختلفة من العالم.
كما أن المؤسّسة تحتفظ بمراسلات مستمرة مع الكثير من الأساتذة والمستشرقين والمفكرين ذوي الاختصاصات العلمية الرفيعة ، وتواصل بشكل دوري منتظم تزويدهم بأهمّ منشوراتها ، مع حرصها على الاستفادة الممكنة من الخبرات العلمية في مجال التراث والبحوث العلمية المتعلّقة به.