شاركت مؤسسة آل البيت (عليهم السلام) مشاركة فاعلة و متكررة في مجمل المؤتمرات الفكرية المهمة التي اُقيمت على أرض الجمهورية الإسلامية وخارجها ، لما تعتقده من الدور الفاعل الذي من الممكن أن تضطلع به هذه الملتقيات الفكرية وما يمكن أن تقدمه من خدمات جادة في رفد حركة إحياء ونشر الفكر الأصيل لآل البيت (عليهم السلام) ، ووضعه في المكان اللائق الذي ينبغي أن يتصدى له.
والحق يقال إن هذه المؤتمرات كانت موفقة إلى حد بعيد في تحقيق الغرض الذي اُقيمت من أجله ، وهذا ما كانت تحرص المؤسسة على أن تكون عنصراً فاعلاً ومؤثراً فيه من خلال تجنيد كلّ إمكانياتها الممكنة في هذا الملتقى المهم ، سواءً أكانت مساهمتها في هذا المؤتمر من خلال تقديم بعض الكتب المحققة التي تخص المناسبة المحتفل بها والمقام من أجلها هذا المؤتمر، أو قيامها بتعريف وتقييم بعض الأعمال الفكرية المتبناة من قبل المؤتمرين ، أو المساهمة في طبع ونشر الأعمال المقدّمة وتقديم أشكال الدعم الممكن قبل وأثناء وبعد انعقاد هذه المؤتمرات.
ومن المؤتمرات التي كان للمؤسسة شرف المساهمة في المشاركة فيها:
1- مؤتمر الإمام الرضا (عليه السلام).
2- مؤتمر نهج البلاغة ، قم ، ايران.
3- مؤتمر الشيخ المفيد ، قم ، ايران.
4- مؤتمر الشيخ الأنصاري ، قم ، ايران.
5- مؤتمر الفيض الكاشاني ، قم ، ايران.
6- مؤتمر الغدير ، لندن ، بريطانيا.
وغيرها من المؤتمرات.